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期刊政策 | The BMJ数据共享和代码共享政策更新

  • 来源:未知
  • 作者:bmjchina
  • 日期:2025-02-24
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《英国医学杂志》(The BMJ)就研究论文更新了数据共享和统计学代码共享的相关政策具体如下:

数据共享
发表于The BMJ的所有研究论文均应包含一份数据可用性声明(Data Availability Statement),具体要求因研究类型而异。投稿论文时,作者应于ScholarOne投稿系统“Step 6: Details & Comments”的“Data sharing”一栏中填写相关声明,该部分内容将作为数据可用性声明进行发表。

关于不同类型数据可用性声明的写作要求,请参考BMJ作者中心(BMJ Author Hub)数据共享政策相关内容:https://authors.bmj.com/policies/data-sharing/

临床试验论文
对于2024年5月1日后投稿的临床试验论文,The BMJ要求作者在投稿时提供支撑研究结果的原始数据,包括论文中分析、结果和结论所依据的所有个体患者的匿名数据。作者应将相关数据上传至开放的数据储存库,并在数据可用性声明和正文中进行引用。所使用的数据储存库应:

符合开放许可要求或允许无障碍访问;并
为数据集提供稳定、持久的标识符,如DOI。

Dryad是符合上述要求的数据存放平台之一。它能够实现开放的数据存档,并可通过DOI从数据集直接链接至论文,或是从论文链接至数据集。其他符合要求的的数据库包括Vivli、Synapse 和UK Data Service等。作者也可以自行查找其他符合上述两条标准的机构、资助者或特定学科数据库以供数据存放。

非临床试验的研究论文
对于非临床试验的研究论文,The BMJ不要求作者共享数据,但仍要求作者在投稿论文时提供一份数据可用性声明。The BMJ鼓励作者声明他们将应合理请求提供数据(Data are available upon reasonable request)。

读者在请求共享The BMJ中此类论文的数据时,应按以下流程提出申请:

提交对该论文的快速回复(rapid response),并向通讯作者发送电子邮件,请求其提供相关数据。
准备好向论文作者提供拟开展研究的详细研究方案,并提供计划用于开展这一研究的研究资金和资源等相关信息。
在合理情况下,可邀请原作者参与数据的再分析。
如果一个月后仍未收到原作者回复,请发送电子邮件至The BMJ研究论文主管Elizabeth Loder(eloder@bmj.com),说明数据共享请求的情况和对应的论文,并抄送papersadmin@bmj.com。
The BMJ将对数据共享请求进行评估。如果该请求合理,The BMJ将鼓励原作者或其所在机构共享数据,但期刊并不能强迫他们公布数据或促成他们与请求者之间达成协议。The BMJ的职责仅限于使数据共享请求的过程公开透明:与请求相关的所有通信都可能经由对论文的快速回复进行公开。


代码共享
对于2024年5月1日及之后投稿的所有研究论文,The BMJ要求作者提交用于分析数据和生成结果的统计学代码。The BMJ不会将代码审核纳入常规审稿流程,但编辑和读者可在需要时对代码进行审查。

投稿论文时,作者必须将这部分代码作为补充文件进行提交,且最好将代码存放在永久开放的代码数据库中,如Github、Gitlab、OSF或Zenodo。对于存放于Github repositories的代码,请包含相应的commit ID。代码应具有机器可读性,并附有适当注释,以便人类读者理解代码的意图或目的。代码应以所用软件的标准格式或文本文件的格式进行上传。

对统计学代码的进一步要求如下:

软件:应包含对软件版本的说明,且如果适用,还应包含所使用的库和包。
注释:应有适当的注释,以帮助读者理解每部分的操作内容和原因。
清晰度:应清晰易读,方便人类读者阅读。
可用性:应能在常用的统计分析软件中运行。例如R、SAS、Stata、Julia和Python。理想情况下,也应适用于开源软件。对于具有图形用户界面的软件(如SPSS、Jamovi、JASP、Stata、SAS JMP),应尝试导出用于数据准备或分析的底层代码。应能在使用适当数据集的情况下无差错地运行。
使用许可:The BMJ鼓励在提交代码时附带开放使用许可声明。

关于本次政策更新的背景和The BMJ在提高研究透明度方面的承诺,欢迎阅读The BMJ主编Kamran Abbasi博士和研究论文主管Elizabeth Loder教授撰写的社论:https://www.bmj.com/content/384/bmj.q324

如您有任何相关疑问,请随时与负责稿件的责任编辑沟通。

 

关于The BMJ

The BMJ是享誉世界的综合医学期刊之一,出版高质量的研究、综述、专家评述、权威观点及医学教育内容等。秉持“创造一个更健康的世界”的愿景,The BMJ致力于为医生、研究人员和其他医疗卫生专业人士提供知识与信息,帮助医生做出更好的临床决策,最终改善患者结局。

 

2023年影响因子:93.7

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